Это больно. Сочувствую вам и сыну.
Если невозможно восстановить общение, то да, нужно объяснять, ориентируясь на те вопросы, которые задаёт сын и на его возраст.

Общий посыл:

Так бывает и это очень грустно.
Взрослые могут вести себя жестоко, нелогично, могут испугаться чего-то, могут с чем-то не справиться.
И дети в этом не виноваты.

А также помогать сыну проживать чувства.